Q1:没有扩增产物： 

A1:① 样品在收集过程中丢失： 重新收集样品，确定不会因操作不当，造成样品意外丢失。 

② 基因组DNA样本中含有抑制反应的成分： 纯化或者稀释DNA样品。如果样品纯化过程中有乙醇沉淀或漂洗步骤，样品中残留的酒精会抑制反应，纯化过程中要让酒精充分挥发。 

③反应温度过高： 反应温度应控制在30℃，过高的温度会使聚合酶失活，如果使用具有热盖功能的PCR仪 进行反应，请将热盖温度设为70℃。 

Q2:扩增产生7.5 - 20 μg DNA，但检测到部分染色体错位或等位基因丢失： 

A2:①对于以基因组DNA为起始模板的反应： 基因组DNA存在降解。应使用完整的DNA或使用更多量的DNA做为模板。 

②对于以细胞作为起始的反应：细胞存在凋亡或者细胞被固定过导致DNA降解；细胞存在难以被裂解的细胞壁(如植物细胞)不适合直接作为起始材料。 

Q3:阴性对照有一定的产出，但下游检测结果为阴性(如qPCR)： 

A3:无模板的阴性对照反应中，由引物的随机聚合延伸产生的高分子量DNA产物，这种产物不影响目的产物的质量及下游分析。 

Q4:阴性对照扩增产生7.5 - 20 μg DNA，且下游检测结果为阳性(如qPCR)： 

A4:可能存在交叉污染，由于本反应对微量DNA非常敏感，替换掉所有可能被DNA污染的试剂及用品。