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Q1: 该试剂盒是否包含打断步骤?
A1:包含。 TruePrepTM试剂盒采用新型的转座酶法进行DNA片段化,将繁琐的DNA片段化、末端修复和接头连接反应等步骤变为一步简单的酶促反应,显著缩短了实验耗时。
Q2 :TruePrep系列试剂盒利用转座酶打断DNA是否存在偏好性?
A2: 转座酶打断时存在一定的偏好性,但测试表明其并不影响测序结果及数据分析。
Q3 :可否采用TD502或TD503构建50 ng起始的DNA文库?
A3:不推荐这么做, TD501、 TD502、 TD503分别对应的模板投入量为50 ng、 5 ng 和1 ng,相应试剂盒中酶的浓度不同。如采用TD502或TD503构建50 ng起始的DNA文库,将使模板DNA片段化不完全或者大小偏大,导致最终的文库与预期相差较远。因此强烈建议根据实际DNA起始量选择相应规格的产品。
Q4 :使用TD501/502/503构建DNA文库时, 55°C反应10 min后可否不用磁珠纯化或TS 溶液终止反应,而直接进行PCR文库扩增?
A4:请按照说明书流程进行纯化或终止反应,否则片段化反应不能有效终止,可能导致最终的文库总长度与预期相比偏小、文库质量较差等。转座酶对后续的PCR反应用比较强的抑制作用,所以需要经过纯化或者终止的方式解除对后续PCR的抑制作用,这一步不能省略。
Q5 :TruePrep系列能提供多少index组合?
A5:最多提供384种index组合。其中TruePrepTM Index Kit V2 for Illumina® (Vazyme#TD202)包含8种N5XX和12种N7XX,可提供96种index组合; TruePrepTM Index Kit V3 forIllumina®(Vazyme #TD203)包含16种N5XX以及24种N7XX,可提供384种index组合。